MassARRAY质谱分析脑胶质瘤6个基因11个突变位点的方法建立与应用
作者: 赵焕英 隋雷鸣
单位:首都医科大学中心实验室基因组学研究平台,北京 100069
摘要: 目的:基于MassARRAY质谱分析技术建立脑胶质瘤6个基因11个位点的突变检测方法.方法:通过文献检索并结合对脑胶质瘤分子病理的研究进展,确定了与临床分级、诊断、及预后密切相关的6个靶基因,对目的基因进行突变位点筛选并确定热点突变.按MassARRAY突变位点标示方法和引物设计固定格式,将基因突变位点进行标注,并利用Agena BioScience在线软件,设计突变位点的正、反向扩增引物和延伸引物.收集40例脑胶质瘤患者的石蜡样本建立检测方法,并采用聚合酶链式反应(PCR)联合一代测序方法进行结果验证.结果:筛选出8对扩增引物和11条延伸引物,通过2组多重PCR扩增延伸及质谱解吸电离技术实现11个位点的基因分型检测.与一代测序法相比灵敏度为100%,特异度为97%.结论:成功建立MassARRAY质谱分析脑胶质瘤6个基因11个位点突变检测方法,与一代测序相比质谱分析法更经济和更节约时间.
关键词:
Array
所属期刊栏目:
研究与讨论
分类号:
页码:
75-81
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